冷凍胚胎是保存生育功能的唯一成熟方法。冷凍胚胎的技術是將通過試管培育技術得到的胚胎，存置於零下196℃的液氮環境中，得到長時間保存。如果這個週期治療失敗，可以在以後的自然週期中解凍這些胚胎並進行移植。

將胚胎和冷凍液裝入冷凍管中，經過慢速（第2-3天的胚胎）和快速（第5-6天的囊胚）兩種降溫方式使胚胎能靜止下來並可在196度的液氮中保存的一種方法。若有剩餘的質量較好的胚胎，可以冷凍保存，待以後自然週期或人工週期解凍後植入子宮腔內，將增加受孕的機會。